Juodeikių Šv. Jono Krikštytojo bažnyčia pastatyta kunigo Vincento Jarulaičio rūpesčiu 1920 m. 1921 m. pastatyta klebonija. Bažnyčia liaudiškų formų, stačiakampio plano, su trisiene apsida, vieno bokšto. Išorėje sienos apkaltos lentomis vertikaliai. Bokštas neiškištas, su keturiais dvišlaičiais stogeliais ir smaila kampuota viršūne. Jo priekis pratęstas pagrindiniame fasade. Durys lentų, dėtos ,,eglute”. Langai stačiakampiai. Zakristijos abipus presbiterijos. Vidus halinis, trijų navų, atskirtų šešiais kvadratinio pjūvio stulpais. Vidurinės navos lubos įlenktos, šoninių – plokščios. Sienos viduje vertikaliai apkaltos lentomis. Vargonų choras ant keturkampių stulpų. Trys mediniai, neoklasicistiniai altoriai.