Kupos upės slėnis – svarbiausia Kupiškio gamtinė teritorija, kertanti miestą per patį vidurį. Kupa – tipiška šiaurės ir vidurio Lietuvos upė, kairysis Lėvens intakas, kuri žemupyje 3,2 km ilgio ruože kerta Kupiškio miestą, įgilintu slėniu dalindama jį į 2 dalis. Slėnyje įrengtos 2 apžvalgos aikštelės, pasivaikščiojimo takai, pavėsinės, suoliukai, pastatyti 2 tiltai.
Patvirtinus 2000 metais parengtą „Gamtotvarkos priemonių įgyvendinimo Kupos upės slėnio teritorijoje“ projektą, atlikti slėnio tvarkymo darbai: išvežtos šiukšlės, iškirsti savo funkcijos neatliekantys krūmai, baltalksniai, akmenimis ir betonu sutvirtinti upelio šlaitai, įrengti du nauji pėsčiųjų tiltai, dviračių ir pėsčiųjų takai, apžvalgos aikštelės, įvesti nauji želdiniai. Pagerėjo priėjimas prie vandens, rekonstruotas užterštas tvenkinys prie Atodūsių tilto, pagerinti kokybiniai ir kiekybiniai upelio vandens rodikliai, sanitariniai pakrančių aplinkos ir daugelis kitų darbų. Sutvarkyta 16 ha Kupos slėnio.