Molėtų krašto muziejuje per visą gyvavimo laikotarpį sukaupta 30 tūkst. eksponatų. Didžiąją eksponatų dalį sudaro rajone vykdomų archeologinių kasinėjimų medžiaga, kitaip tariant, šukės. Nemažą dalį sudaro rašto artefaktai. Retkarčiais nusišypso laimė gauti ypač vertingų eksponatų. Paprastai tokie eksponatai patenka tiesiai į pastovią ekspoziciją, o jų istorijos pasakojamos lankytojams. Iš tokių reikia paminėti A. Umbraso sukonstruotą seniausią televizorių. Šis seniausias televizorius Lietuvoje – vertingiausias Molėtų krašto muziejaus eksponatas. Labai vertingų eksponatų dovanojo prof. V. Kaušinis. Armonikininkas, puikus medžio drožėjas, tautodailininkas Jonas Matulionis Alantos dvaro muziejui-galerijai padovanojo savo medžio dirbinius-minitechninius visokiausių senųjų amatų modelius. Tokių istorijų daug. Kiekvienas eksponatas, kaip ir žmogus, turi savo gyvenimą. Kiekvieno kelias į muziejų skirtingas. Visada mielai bendradarbiaujame su rajono senaisiais gyventojais. Dažnai jie turi kažką vertingo papasakoti ar perduoti muziejui.
Iš rečiausių eksponatų galima būtų minėt Arnionių bažnyčios kryžių, ornamentuotą verpstę, drožinėtą kėdę, kraičkubilį. Bet muziejuje svarbiausi yra rinkiniai. Visos lietuviško stiklo eksponatų kolekcijos gavimas iš kraštiečio K. Strazdo prilygo stebuklui. Tikras stebuklas, kad Molėtų rajone yra Ežerų žvejybos muziejus, kuriame sukaupta labai vertingų eksponatų: archajiški luotai, visokiausi senoviniai žuvų gaudymo įrenginiai, žvejų įrangos gamybos įrankiai. Videniškių vienuolyne formuojasi kunigaikščių Giedraičių istorijos rinkinys, eksponuojama vienos žymiausių margutininkių V. Giedrytės margučių kolekcija.