Šilutės Hugo Šojaus muziejus įkurtas XIX a. pabaigoje dvarininko Hugo Šojaus. Matydamas, kaip dėl Pramonės revoliucijos Prūsijos karalystėje nyksta lietuvininkų tradicijos ir verslai, savo dvare pradėjo kaupti Klaipėdos krašto etnografinę medžiagą, rinko tautosaką. Dvaro muziejuje buvo sukaupta etnografinių baldų, rūbų, dokumentų, spaudinių, žemėlapių kolekcija. Tai buvo pirmasis muziejus Klaipėdos krašte, prieinamas inteligentijai, mokslininkams. Antrojo pasaulinio karo metais dvaras ir dvaro muziejus labai nukentėjo. Tuo metu čia apsistojusi Raudonoji armija nuniokojo muziejų. 1948 m. rugpjūčio mėn. dvaro pastatai buvo perduoti sodininkystės ir bitininkystės mokyklai, o muziejus perkeltas į buvusį gyvenamąjį namą miesto centre. 1949 m. lapkričio 7 d. atidarytas Šilutės Kraštotyros muziejus. 1990 m. Šilutės kraštotyros muziejus buvo pervadintas į Šilutės muziejų. 2005 m. sausio mėnesį į restauruotą Hugo šojaus dvarą persikėlė Šilutės muziejus.
