Vainatrakio piliakalnio aikštelė apardyta XIX a. – XX a. pirmoje pusėje joje veikusių protestantų kapinių. Vadinamosiose Prūskapinėse vokiečių dvarininkai laidojo savo šeimos narius iki 1921 m., vėliau šiuos kapus iškasinėjo lobių ieškotojai. Kalva apsupta apdirbtų laukų, ruože tarp Striaunės kanalo ir piliakalnio neapdirbama, laisvai veši augmenija. Piliakalnis apaugęs lapuočiais medžiais, krūmokšniais. Ant kalvos tarp sunkiai praeinamų sąžalynų, išvartų aptinkamos antkapių liekanos.